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생물정보분석(Bioinformatics)

최신 NGS 기술과 축적된 생물정보 분석 경험을 바탕으로

다양한 생물 시료 및 유전체 정보를 정밀하게 해석해드립니다.

고객의 연구 목적에 맞춘 1:1 맞춤형 분석 설계와 고품질 결과 보고서를 제공하며,

기초연구부터 산업 응용까지 폭넓은 분석 서비스를 지원합니다.

✅ 제공 가능한 주요 분석 서비스

분석 항목	설명 및 활용 분야
전장 유전체 분석 (WGS)	Whole Genome Sequencing: 온 전체의 유전체 정보를 획득하여 구조 및 변이 분석 (신약 개발, 품종 개량, 유전 질환 연구 등)
전사체 분석 (RNA-seq)	유전자 발현량 및 차등 발현 분석 (세포 반응, 질병 비교 분석, 유전자 조절 연구 등)
엑솜 분석 (WES)	단백질 코딩 영역만을 선택하여 유전 질환 관련 변이 탐색
타겟 유전자 패널 분석	특정 유전자 집합을 대상으로 변이 분석 (암, 희귀질환 진단 등)
Target Amplicon 분석	관심 유전자 영역만을 증폭하여 정밀 분석 (질병 마커, 유전 다양성, 병원체 진단 등)
메타지놈/메타바로믹 분석	환경 및 식품 내 미생물 군집 구조 및 기능 분석 (장내 미생물, 환경 모니터링 등)
바이러스 분석	다양한 DNA/RNA 바이러스의 정량, 분류, 변이 분석 (감염병 진단, 백신 개발 등)
미토콘드리아/염색체 유전체 분석	전체 계통 분석, 돌연 변이 탐색 연구 (식물육종, 질병 관련 연구 등)
에피유전체 분석	DNA 메틸화, 히스톤 변형 등 후성유전체 정보 분석 (암 및 발현 조절 연구 등)
변이 분석 및 유전자 발굴	SNP, InDel, CNV, SV 등 다양한 유전적 변이 검출
Ultra Scaffold 제작	특이 Scaffold 제작 설계를 통해 고속 유전체 조립 및 정확하게 연결
클론 라이브러리 제작 및 스크리닝	벡터 클로닝 및 유전자 발현 분석용 3D 클로닝을 활용한 효율적 스크리닝
맞춤형 진단 키트 개발	PCR 기반의 특이 유전자 진단 키트 제작 (예: 프로포커스 유전자 진단 키트)

연구사례

환자검체 monocyte 시료로부터 RNA 시퀀싱 후 read의 FPKM
(Fragments Per Kilobase of transcripts per Million mapped reads) 분석
미생물 균주의 국산화 개발을 위한 후보균주(Saccharomyces cerevisiae)의 Pane genome 분석
NGS RNA 데이터를 이용한 바이러스 분석(BLAST)
mRNA read 분석(Ratio 및 mRNA half life time 분석)
살균소독제 노출에 따른 그람음성균의 전장유전체 및 전사체 변화양상 분석
BCG 백신의 표준화 연구를 위한 싸이토카인 유전자 발현 평가
장어 DEG/GO 분석(6종)
Plasmid circle map 제작
벼멸구 12종 DEG 분석
RSIV 감염 조직의 DEG/GO/분석
김 DEG 분석.
마우스 장기 처리군별 DEG 분석
자유아메바 DEG 분석
차응애 DEG 분석 (2회 등장)
박테리아 2종의 DEG/GO 분석
마우스 장기 처리군별 DEG 분석
유산균 성장관련 유전자 탐색을 위한 DEG/GO 분석
김 (골드2호) 품종간 유전적 변이 분석
박테리아 50종에 대한 전사체 분석 및 DEG, GO 분석
아조변이 사과 GO 분석
박테리아 DEG 분석
대장암 유전자 변형에 따른 발현량 비교 분석(NGS)
어류병원세균 1종 전체 염기서열 분석 (Genome browser system구축)
신약후보물질 스크리닝을 위한 실시간 단백질결합 분석시스템 개발
돼지 BAC clone 갭 제거

Phylogenetic tree for mutation of antimicrobial resistance(AMR) gene

Reference : Whole genome‑based characterisation of antimicrobial resistance and genetic diversity in Campylobacter jejuni and Campylobacter coli from ruminants

Minimum spanning tree for MLST profiles

Reference : Whole genome‑based characterisation of antimicrobial resistance and genetic diversity in Campylobacter jejuni and Campylobacter coli from ruminants

Phylogenetic distance using virulence factor(VF)

Reference : Genomic Analysis and Antimicrobial Resistance of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli in Peru

Visualization for Point mutation of drug-resistance genes

"Reference : Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrugresistant

tuberculosis"

Genome structure comparison of phages

Reference : The Shiga toxin 2 production level in enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 is correlated with the subtypes of toxin-encoding phage

Pairwise of chromosomal synteny between strain

Reference : Pangenome analyses of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici reveal the structural basis of a highly plastic eukaryotic genome

Visualization for pangenome analysis results

- Venn diagram of the singleton, accessory, and core genes of the pangenome

- Categorization of the pangenome into singleton, accessory, and core genes.

- Number of accessory gene clusters.

- Estimation of the sizes of the core genome and the pangenome.

Reference : Pangenome analyses of the wheat pathogen Zymoseptoria tritici reveal the structural basis of a highly plastic eukaryotic genome

SNP-phylogenetic-tree-for-8-MTBC-isolates-within-a-large-MIRU-cluster-G-The-MIRU-VNTR.png

Phylogenetic tree of VNTR or SNP

*Reference : Whole genome sequencing analysis of multidrug-resistant tuberculosis in Singapore, 2006–2018

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