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Metagenome

배양이 어려운 미생물까지 포함하여,
시료 내 전체 미생물의 유전체(DNA)를 직접 추출하고 고속 NGS로 분석함으로써
미생물의 다양성, 상호작용, 기능 유전자까지 종합적으로 파악할 수 있는 기술입니다.



 분석 가능한 시료 예시
  1. 토양, 담수, 해양 등 환경 시료
  2.  장내/피부/구강 등 체내 미생물 시료
  3. 발효식품, 공장 배양액, 폐수 등 산업 시료
  4.  반려동물/가축의 장내 시료 등


 요 분석 항목

분석 항목
내용 및 목적
미생물 다양성 분석OTU 또는 ASV 기반의 
α-다양성, β-다양성 분석
종 수준 분류Taxonomic classification 
(Domain ~ Species)
기능 유전자 예측
KEGC, COG, eggNOG 등을 
활용한 대사경로 예측 및 기능분석
상관관계 분석미생물 간 상호작용 네트워크 
및 환경인자와의 연관성 분석



 술 방식
  1.  16S/18S/ITS rRNA 기반 메타바코딩 분석: 특정 마커 유전자 증폭 후 시퀀싱
  2.  Shotgun 메타지놈 분석: 전체 유전체 서열을 기반으로 
    ​고해상도 미생물 분석 및 기능 예측 가능


활용 분야
  1. 장내 미생물과 질병의 연관성 연구
  2. 환경 생태계 모니터링 및 환경 정화 연구
  3. 식품 및 발효 산업에서 미생물 품질 관리
  4. 반려동물/축산 미생물 생태 분석
  5. 항생제 내성 유전자 모니터링 및 병원체 추적
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연구사례

  1. 가공육 환경 시료를 대상으로 한 16S/ITS 분석(21~ 현재)
  2. 하수 슬러지 위치별 미생물 군집 비교 분석
  3. 사향노루의 분변을 이용한 주요 먹이원(ITS) 분석(22년~ 현재)
  4. 발효 경과 시간별 치즈 내 미생물 군집 분석
  5. 지역별 토양의 미생물 군집 비교 분석
  6. 가재 내장 조직을 이용한 먹이원 분석
  7. 돼지분변(성돈, 자돈)을 이용한 메타지놈 및 PCA 분석
  8. 진드기 시료내 감염 병원체 분석(바이러스/세균/진균)
  9. 하수 슬러지 16S 메타지놈 분석 2건
  10. 감염원인 자가면역 질환의 분변 WMS(deep whole-metagenome shotgun sequencing) 분석
  11. 돼지분변 메타지놈 분석
  12. 모기 장내 메타지놈 분석 (다수)
  13. 가공육 16S/ITS 메타지놈 분석
  14.  e-DNA 기반 메타지놈분석
  15. 장내 미생물 메타지놈 분석
  16. 퇴비 5종의 메타지놈 분석
  17. 발효 가공육내 메타지놈 분석
  18. 박쥐 환경시료에 대한 ITS 메타지놈 분석
  19. 해삼의 유생 및 해수의 메타지놈 분석
  20. 환경시료 메타지놈 분석 (16S/ITS)
  21. 천마 무름병 분석 위한 메타지놈 분석 (ITS)
  22. 환경 액상 시료의 메타지놈 분석(16S, ITS)
  23. 된장 2종의 메타지놈 분석(16S/ITS)
  24. 하수종말 처리장 구역별 미생물 분포도 분석, 16s Amplicon sequencing (GSFLX)
  25. 중국산, 국내산 바지락 NGS 분석 및 16s amplicon 분석
  26. 2개 사육지 환경시료 메타지놈 분석 (16S)
  27. 환경 액상 시료의 메타지놈 분석(16S, ITS)
  28. 돼지 분변 6종의 메타지놈 분석(16S)
  29. 연체규 66종에 대한 16S, COl분석
  30. 된장 2종의 메타지놈 분석(16S/ITS)
  31. 2개 사육지 환경시료 메타지놈 분석 (16S)
  32. 천마 무름병 분석 위한 메타지놈 분석 (ITS)
  33. 환경 액상 시료의 메타지놈 분석(16S, ITS)
  34. 돼지 분변 6종의 메타지놈 분석(16S)
  35. 된장 2종의 메타지놈 분석(16S/ITS)
  36. 목장 시료 9종에 대한 메타지놈분석
  37. 유황오리 소장분변 메타지놈 분석
  38. 중국산, 국내산 바지락 NGS 분석 및 16s amplicon 분석
  39. 하수종말 처리장 구역별 미생물 분포도 분석, 16s Amplicon sequencing (GSFLX)
  40. 흑염소 반추위 미생물 메타게놈 차세대 염기서열 결정